En los bosques de Pino-Encino de Centroamérica se han registrado alrededor de:
107 especies de anfibios
194 especies de reptiles
203 especies de mamíferos
349 especies de aves
10 especies de pinos
42 especies de encinos
Las especies varían en su distribución de norte a sur, siendo Guatemala el país con mayor riqueza de especies de pinos y encinos en este tipo de bosques.
Únicamente tres especies de pinos se tienen en común en todos los países: Pinus oocarpa, P. maximinoii, y P. tecunumanii.